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南京農(nóng)大粟碩教授等大數(shù)據(jù)分析冠狀病毒進化與重組

  文章出處:江蘇科晶 點擊次數(shù): ;     更新時間:2023-04-21

2016年3月21日,國際學(xué)術(shù)權(quán)威刊物《Cell》旗下子刊《Trends in Microbiology》在線發(fā)表了題為“Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses”的論文。該文章第一作者和通訊作者為南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院長江學(xué)者周繼勇團隊的粟碩教授,共同通訊作者為中國科學(xué)院青年傳染病專家畢玉海副研究員和中國科學(xué)院高福院士。

冠狀病毒(CoV)感染主要引起呼吸系統(tǒng)(雞傳染性支氣管炎病毒、犬冠狀病毒)和消化系統(tǒng)疾病(豬傳染性胃腸炎病毒、牛腹瀉病毒、犬冠狀病毒、貓冠狀病毒等)。人的冠狀病毒感染同樣以呼吸系統(tǒng)疾病和消化道疾病為主要特征,但疾病發(fā)生程度有很大差異。到目前為止,主要感染人的冠狀病毒有6種:229E、OC43、NL63、 HKU1、非典型肺炎病毒SARS-CoV和中東呼吸熱綜合征病毒(MERS-CoV)。

其中SRAS-CoV在2003年引起了8273人感染,包括775人死于該疾病。MERS-CoV是2014年又一次爆發(fā),截止到2015年12月31日,該病毒引起1621人感染,584人死亡,成為對人威脅和危害性極大的疾病之一。盡管MERS病毒目前仍然是有限的人傳人的能力,但是仍需要監(jiān)控其重組和進化,以防止其一旦適應(yīng)人類后造成的潛在的大流行。

針對目前MERS等冠狀病毒復(fù)雜的流行情況和快速的重組等特點,這篇文章利用先進的生物信息學(xué)分析方法從流行病學(xué)調(diào)查、發(fā)病機理、進化和重組情況等方面對不同的冠狀病毒進行了比較分析,并且用大數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)監(jiān)測和分析病毒序列預(yù)測了存在潛在威脅的動物源性重組冠狀病毒,文章最后針對MERS,SARS等冠狀病毒的頻繁重組提出了具體防控建議。該論文也是南京農(nóng)業(yè)大學(xué)青年傳染病專家粟碩教授繼柳葉刀雜志回溯流行病學(xué)分析MERS病例輸入中國之后,再一次在高水平權(quán)威期刊發(fā)表關(guān)于MERS等新發(fā)傳染病流行病學(xué)的論文。


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